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    NanoString nCounter检测

    NanoString技术被越来越广泛地应用到生物医学前沿领域,包括高通量基因表达结果验证、基因表达谱研究、基因调控网络研究、临床疾病分子分型及诊断预后等领域。

    解决方案

    • 转录水平RNA高通量研究为人们深入了解生物学过程中转录调控、信号转导机制、疾病分子病理分型等提供了重要的研究方法。
      常用的高通量研究方法如基因芯片、RNA测序等,可产生大量信息,然而这些技术对样品质量要求很高,同时费用昂贵。且其实验结果往往需要做qPCR进行验证。然而在对多基因进行定量研究时,传统的qPCR方法由于实验操作步骤多且繁复,通量明显不足,无法满足多重基因定量检测的需求。此外,临床样品通常为FFPE样本,在制备和储存过程中会造成大量RNA降解、断裂。因此,qPCR及RNA-seq都难以对这种样本进行精确定量分析。
      针对以上问题,NanoString给出了完美的解决方案:
      基于杂交原理建立的NanoString数字化基因分析系统直接检测条形码探针标记的单个mRNA转录子,并通过数字计数进行定量。此过程无需酶促和扩增过程。仅需100 ng的RNA即可对逾八百个特异的mRNA转录子进行准确的定量。其检测的敏感性和准确性与实时定量PCR(RT—PCR) 技术相当。
    • NanoString技术可以不经过RNA提取,直接在FFPE样本,细胞裂解液乃至全血中对RNA进行定量,进一步降低由于提取过程可能带来的潜在偏差。
      近年来,NanoString技术被越来越广泛地应用到生物医学前沿领域,包括高通量基因表达结果验证、基因表达谱研究、基因调控网络研究、临床疾病分子分型及诊断预后等领域。

    NanoString技术特点

    • 数字化-单分子数字式直接计数,可用于数字化分析或验证第二代测序所确定的目标高精准度-无需逆转录、 PCR扩增,直接检测RNA分子数量,得到基因表达情况高灵敏度- 飞摩尔(10-15)级别灵敏度,与qPCR匹敌多重检测- 单管最多可同时检测800种目标分子自动化程度高- 只需要三个简单手动操作步骤,最大程度避免人为因素的干扰样本兼容性高- 高效检测FFPE包埋切片,直接检测血液和细胞裂解液等,无需RNA提取纯化应用广泛- Gene Expression, miRNA Expression, miRGE, CNV, Gene Fusion, Single Cell Expression, Protein, RNA & Protein共检测
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      nCounter SPRINT
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      nCounter Pro
    • 技术原理
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    • 操作流程
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    • 结果分析
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      nSolver Analysis Software
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      ROSALIND® Platform
    • 针对不同通路所生成的热图
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      细胞因子和趋化因子通路
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      JAK-STAT信号通路
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      NF-kappaB信号通路
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      Wnt信号通路
    • 不同通路基因在火山图中的表现
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      细胞因子和趋化因子通路
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      JAK-STAT信号通路
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      NF-kappaB信号通路
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      Wnt信号通路
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